Erst einmal wäre es interessant zu wissen, unter welchem OS dein Problem auftritt.
Zu den Lesezeichen:
Die Lesezeichen werden in der Datei "bookmarks.html" abgespeichert
Füge folgendes also folgendes zu deiner user.js hinzu
Code
// Festlegen, welche Lesezeichendatei genutzt werden soll:
user_pref("browser.bookmarks.file", "C:\\Pfad zu deinem Mozilla-Profil\\bookmarks.html");
Aber beachte: Du darfst immer nur einen von beiden Browsern öffnen. Denn Phoenix/Mozilla speichern ihre Einstlungen beim schließen in die "bookmarks.html"-Datei. Wenn dann erst der eine, und dann der andere geschlossen wird, werden nur die Lesezeichen des zuletzt geschlossenen Browsers abgespeichert.
Gruß
Abdulkadir Topal