Das ist korrekt, das alte und das neue Sync sind nicht kompatibel zueinander. Das ist aber kein großes Problem. Es gibt halt keine direkte "Upgrade-Möglichkeit" um dich von dem alten Sync auf das neue zu bringen, das heißt, du müsstest dir mittelfristig einen neuen Account für das neue Sync anlegen. Das müsste nicht zu Firefox 29 sein, das alte Sync wird erstmal weiterhin parallel zur Verfügung stehen. Es wird aus Firefox entfernt werden, das wird allerdings vor Firefox 31 definitiv nicht passieren. Und ab Firefox 29 kannst du bereits keine weiteren Geräte mehr zum alten Sync hinzufügen. Geräte müssen also zum alten Sync hinzugefügt werden, solange du Firefox 28 nutzt. Und ab Firefox 29 kann man nur noch das neue Sync einrichten. Ein Mischbetrieb Altes Sync <-> Neues Sync ist nicht möglich.
Aber du kannst durchaus jetzt noch das alte Sync nutzen und mit Firefox 29 deine Sync-Verbindung trennen und dann einen Account für das neue Sync anlegen und damit dann synchronisieren. In Anbetracht der wirklich nur noch kurzen Zeit bis Firefox 29 lohnt es sich aber vielleicht auch noch zu warten. Das alte Sync ist etwas kompliziert in der Einrichtung, das ist mit dem neuen Sync viel einfacher. 