@Malte: Die Funktion zum automagischen Erstellen von Searchplugins speichert die neuen Plugins ja in einem Ordner "searchplugins" im Profil, während meine bisherigen Plugins im gleichnamigen Order im Fx-Installationspfad liegen. SEO mischt die dann problemlos zusammen.
Die Verlagerung der searchplugins ins Profil finde ich eine gute Sache, das scheint wohl ein Feature zu sein, das mit dem Fx1.5 gekommen ist; um das zu testen, habe ich alle meine searchplugins ins Profil verschoben, klappt prima.
Auch wenn ich den Ordner "searchplugins" im Fx-Installationspfad komplett lösche, läuft der Fx noch gut und zeigt alle Plugins an, SEO hat damit aber offensichtlich ein Problem; im Dialog können die einzelnen Einträge nicht mehr ausgewählt werden.