In alten Versionen (bis 0.9 einschliesslich glaube ich) wurden die Favicons im Cache gespeichert und verschwanden, wenn der Cache gelöscht wurde.
Seit der Version 1.0 werden die Favicons zusammmen mit dem betreffenden Lesezeichen in der Datei bookmarks.html gespeichert und bleiben (wie dei Lesezeichen) erhalten.