Fx nutzt definitiv nicht den IE-Cache. Daher sehe ich nur zwei mögliche Erklärungen:
1. Die Dateien resultieren aus der Nutzung eines Drittprogramms, das im Hintergrund den IE verwendet (z.B. RealPlayer, StarMoney...).
2. Die Anzeige "Internet Explorer Cache" in TuneUp ist falsch und es handelt sich doch um den Fx-Cache. Test: Cache im Fx löschen.
Wie schon gesagt kannst Du Dir den IE-Cache ja auch direkt über den WindowsExplorer anschauen (Ordner Temporary Internet Files) und prüfen, was für Daten das eigentlich sind.
Alexander