Schreib dir noch eine entsprechende Erweiterung, über die kannst du den Fx steuern.
Ich bezweifele, dass es eine Java-Schnittstelle gibt, die du so benutzen kannst. Evtl geht da was über XPCOM u.ä., aber das sind nur irgendwelche Schnittstellen von denen ich gehört hab und ich kann da keine Garantie geben, dass die gut mit Java funktionieren.
Du könntest dir eine Erweiterung schreiben, die Nachrichten durch dein Java-Programm empfängt und entsprechend den Fx steuert. Das hat mit dem Java-Plugin nichts zu tun.
Zitat von LokiHTUeber ein selbstentwickeltes Plugin scheint es mir die beste Loesung zu sein, nur wie schon erwaehnt denke ich nicht, dass das funktioniert. Falls jemand einen Link zu einem Tutorial hat oder irgendeiner anderen Quelle, die bestaetigt, dass es mit einem Plugin prinzipiell moeglich ist Daten aus externen Anwenungen zu empfangen und zu senden, bin ich sehr dankbar.
Du meinst wahrscheinlich Erweiterungen. Plugins sind bei Firefox in Webseiten eigebettete Objekte.
Prinzipiell ist das sicher möglich, die Frage ist, wie gut die Schnittstelle ist. Notfalls könnte man zumindest die kommunikation über Dateien machen, d.h. deine Anwendung schreibt eine Datei, die Eweiterung liest sie, verarbeitet sie und schreibt ne eigene Datei usw. So geht es auf jeden Fall, möglicherweise gibt es bessere Möglichkeiten. (In jedem Fall auch möglich wäre, dass dein Programm einen HTTP-Server aufmacht und mti deiner Erweiterung über xmlhttprequest/Ajax kommuniziert)
Ok, vielen Dank für die Antwort.
Ich denke ich werde das ganze dannüber eine Erweiterung schreiben, die über eine Datei kommuniziert. Falls noch jemand einen guten Einstiegspunkt kennt um sich mit der Entwicklung von Erweiterungen für den Firefox vertraut zu machen nehme ich diesen gerne an 
Für mich ist das absolutes Neuland.
