Den Prozess nicht killen, sondern normal beenden. Ansonsten hilft vielleicht das Überschreiben der sessionstore.js.
Du kannst sie einfach löschen. Wenn das Probleme macht, dann durch eine leere Datei ersetzen.
Warum du die Prozesse nicht normal beendest erklärt das zwar immer noch nicht, aber darum geht es nicht. 
Frohes Fest!
Du könntest auch in der Batch-Datei nach dem Kill des Fx-Prozesses eine vorhandene sessionstore.js löschen. Bei einem Schreibschutz auf die sessionstore.js kann es sein, dass der Fx eine zweite Datei anlegt und du das "Problem" dann wieder hast.
Alternative wäre wohl das via "about:config" zu steuern (z.B. Filter "sessionstore").
