Wo sind die Lesezeichen ?

Die werden im Profilverzeichnis in der Datei places.sqlite abgelegt. Eine Kopie reicht als Sicherung, wobei sich auch das ganze Profil derart sichern lässt.
Nähere Informationen finden sich im Wiki (Link oben).

Nebenbei:
Mit Erweiterungen und Themes hat diese Frage allerdings nichts zu tun.