Für Interessenten!
Unter geänderten Vorzeichen ist die Extension userChromeJS nach 0.7, 0.8 [1] und "Anpassungen" nun in einer Version 1.0 [2] erschienen. Zugelassen ist diese Extension vom weiterführenden Autor für Firefox und Thunderbird ab der Version 3.0 bis 3.*.
Hier gab es (bis Dato) 0 Probleme mit der Übernahme der in Profilen eingebundenen Scripts.
Quelle: http://forums.mozillazine.org/viewtopic.php?p=5294505#p5294505
[1] [Info] userChrome.js
[2] http://userchromejs.mozdev.org/index.html